Condaは、biopythonをインストールしようとした後、見つからない属性エラーシンボルを返します

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dem336 2019-07-03 22:21.

私はbiopythonを機能させるために遊んでいましたが、その過程でcondaを壊したようです。この時点で、condaのヘルプメニューが表示されてconda --version戻りますconda 4.7.5が、それ以外のものconda infoはエラーをスローしますAttributeError: dlsym(0x1004381c0, archive_read_open_filename_w): symbol not found

これはMacOS10.14.4にあります。Condaはちょうど機能していて、最後にそれを使用してエラーなしでbiopythonをインストールしましたconda install -c conda-forge biopythonimport Bioそれでも実行すると、が発生しましたImportError: No module named Bio。そのため、トラブルシューティングで実行しpip uninstall biopython(biopython-1.73のアンインストールに成功したとのことです)、次の結果pip install biopythonが返されました。

Requirement already satisfied: biopython in /Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages (1.73)
Requirement already satisfied: numpy in /Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages (from biopython) (1.13.1)

次に、condaを使用しconda install -c conda-forge biopythonてインストールを再試行しましたが、上記と同じエラーが返されましたconda info。このAttributeErrorは、condaを何かに使用しようとするといつでも表示されます。以下にトレースバックを含めました。助言がありますか?

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/dmattox/anaconda/bin/conda", line 13, in <module>
    sys.exit(main())
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/cli/main.py", line 150, in main
    return conda_exception_handler(_main, *args, **kwargs)
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/exceptions.py", line 1335, in conda_exception_handler
    return_value = exception_handler(func, *args, **kwargs)
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/exceptions.py", line 1046, in __call__
    return self.handle_exception(exc_val, exc_tb)
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/exceptions.py", line 1090, in handle_exception
    return self.handle_unexpected_exception(exc_val, exc_tb)
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/exceptions.py", line 1101, in handle_unexpected_exception
    self.print_unexpected_error_report(error_report)
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/exceptions.py", line 1171, in print_unexpected_error_report
    from .cli.main_info import get_env_vars_str, get_main_info_str
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/cli/main_info.py", line 19, in <module>
    from ..core.index import _supplement_index_with_system
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/core/index.py", line 9, in <module>
    from .package_cache_data import PackageCacheData
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda/core/package_cache_data.py", line 15, in <module>
    from conda_package_handling.api import InvalidArchiveError
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/conda_package_handling/api.py", line 3, in <module>
    from libarchive.exception import ArchiveError as _LibarchiveArchiveError
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/libarchive/__init__.py", line 1, in <module>
    from .entry import ArchiveEntry
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/libarchive/entry.py", line 6, in <module>
    from . import ffi
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/libarchive/ffi.py", line 184, in <module>
    c_int, check_int)
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/site-packages/libarchive/ffi.py", line 95, in ffi
    f = getattr(libarchive, 'archive_'+name)
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/ctypes/__init__.py", line 375, in __getattr__
    func = self.__getitem__(name)
  File "/Users/dmattox/anaconda/lib/python2.7/ctypes/__init__.py", line 380, in __getitem__
    func = self._FuncPtr((name_or_ordinal, self))
AttributeError: dlsym(0x100548400, archive_read_open_filename_w): symbol not found

1 answers

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Poppy Bee 2019-07-09 16:13.

知乎の方法でエラーを修正しました

これが私がそれを解決する方法のステップです、それがあなたに役立つことを願っています:

Macでこのエラーが発生した理由は、Pythonが以前にインストールされていたため、すべてのpythonファイルとAnacondaファイルを削除し、anacondaを再度インストールしてから、condaコマンドを正常に実行しようとしたためです。

  1. Macintouch-> Frameworks-> PythonFramework-> Versions-> 3.xからPythonを削除します
  2. .bash_profile内のpythonとanacondaに関するすべてのレコードを削除します(shift + command +でこの隠しファイルを見つけます)。
  3. アプリケーションでanacondaナビゲーターを削除します
  4. アナコンダを再度インストールする

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