Quiero crear una función myfun
que sólo se puede utilizar dentro de otra función, en mi caso dplyr
s mutate
o summarise
. Además, no quiero depender de los dplyr
componentes internos (por ejemplo mask$...
).
Se me ocurrió una solución rápida y sucia: una función search_calling_fn
que verifica todos los nombres de funciones en la pila de llamadas y busca un patrón específico en las funciones de llamada.
search_calling_fn <- function(pattern) {
call_st <- lapply(sys.calls(), `[[`, 1)
res <- any(unlist(lapply(call_st, function(x) grepl(pattern, x, perl = TRUE))))
if (!res) {
stop("`myfun()` must only be used inside dplyr::mutate or dplyr::summarise")
} else {
return()
}
}
Esto funciona como se esperaba como muestran los dos ejemplos siguientes ( dplyr
= 1.0.0)
library(dplyr)
myfun <- function() {
search_calling_fn("^mutate|^summarise")
NULL
}
# throws as expected no error
mtcars %>%
mutate(myfun())
myfun2 <- function() {
search_calling_fn("^select")
NULL
}
# throws as expected an error
mtcars %>%
mutate(myfun2())
Este enfoque tiene una laguna: myfun
podría llamarse desde una función con un nombre similar que no es una dplyr
función. Me pregunto cómo puedo verificar desde qué espacio de nombres proviene una función en mi pila de llamadas. rlang
tiene una función, call_ns
pero esto solo funcionará si la función se llama explícitamente con package::...
. Además, cuando se usa, mutate
hay mutate_cols
una función interna y mutate.data.frame
un método S3 en la pila de llamadas, ambos parecen hacer que obtener el espacio de nombres sea aún más complicado.
Pensándolo bien, me pregunto si existe un enfoque mejor y más oficial para lograr el mismo resultado: solo permitir myfun
que se le llame dentro de dplyr
s mutate
o summarise
.
El enfoque debería funcionar sin importar cómo se llame a la función:
mutate
dplyr::mutate
Nota adicional
Después de discutir la respuesta de @ r2evans, me doy cuenta de que una solución debería pasar la siguiente prueba:
library(dplyr)
myfun <- function() {
search_calling_fn("^mutate|^summarise")
NULL
}
# an example for a function masking dplyr's mutate
mutate <- function(df, x) {
NULL
}
# should throw an error but doesn't
mtcars %>%
mutate(myfun())
Por lo tanto, la función de verificación no solo debe mirar la pila de llamadas, sino también tratar de ver de qué paquete proviene una función en la pila de llamadas. Curiosamente, el depurador de RStudios muestra el espacio de nombres para cada función en la pila de llamadas, incluso para las funciones internas. Me pregunto cómo lo hace, ya environment(fun))
que solo funciona en funciones exportadas.
Actualización : voy a "tomar prestado" de rlang::trace_back
, ya que parece tener un método elegante (y funcional) para determinar un completo package::function
para la mayor parte del árbol de llamadas (algunos como %>%
no siempre están completamente resueltos).
(Si está tratando de reducir la hinchazón del paquete ... aunque es poco probable que lo haya hecho dplyr
y no purrr
esté disponible , si prefiere hacer tanto en la base como sea posible, he proporcionado #==#
llamadas equivalentes de base-R. Ciertamente es factible para intentar eliminar algunas de las rlang
llamadas, pero de nuevo ... si está asumiendo dplyr
, definitivamente tiene rlang
alrededor, en cuyo caso esto no debería ser un problema).
search_calling_pkg <- function(pkgs, funcs) {
# <borrowed from="rlang::trace_back">
frames <- sys.frames()
idx <- rlang:::trace_find_bottom(NULL, frames)
frames <- frames[idx]
parents <- sys.parents()[idx]
calls <- as.list(sys.calls()[idx])
calls <- purrr::map(calls, rlang:::call_fix_car)
#==# calls <- lapply(calls, rlang:::call_fix_car)
calls <- rlang:::add_pipe_pointer(calls, frames)
calls <- purrr::map2(calls, seq_along(calls), rlang:::maybe_add_namespace)
#==# calls <- Map(rlang:::maybe_add_namespace, calls, seq_along(calls))
# </borrowed>
calls_chr <- vapply(calls, function(cl) as.character(cl)[1], character(1))
ptn <- paste0("^(", paste(pkgs, collapse = "|"), ")::")
pkgres <- any(grepl(ptn, calls_chr))
funcres <- !missing(funcs) && any(mapply(grepl, paste0("^", funcs, "$"), list(calls_chr)))
if (!pkgres || !funcres) {
stop("not correct")
} else return()
}
La intención es que pueda buscar paquetes particulares y / o funciones particulares. El funcs=
argumento puede ser cadenas fijas (tomadas literalmente), pero como pensé que podría querer hacer coincidir con cualquiera de las mutate*
funciones (etc.), también puede convertirlo en una expresión regular. Todas las funciones deben estar completas package::funcname
, no solo funcname
(aunque ciertamente podría convertirlo en una expresión regular :-).
myfun1 <- function() {
search_calling_pkg(pkgs = "dplyr")
NULL
}
myfun2 <- function() {
search_calling_pkg(funcs = c("dplyr::mutate.*", "dplyr::summarize.*"))
NULL
}
mutate <- function(df, x) { force(x); NULL; }
mtcars[1:2,] %>% mutate(myfun1())
# Error: not correct
mtcars[1:2,] %>% dplyr::mutate(myfun1())
# mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
# 1 21 6 160 110 3.9 2.620 16.46 0 1 4 4
# 2 21 6 160 110 3.9 2.875 17.02 0 1 4 4
mtcars[1:2,] %>% mutate(myfun2())
# Error: not correct
mtcars[1:2,] %>% dplyr::mutate(myfun2())
# mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
# 1 21 6 160 110 3.9 2.620 16.46 0 1 4 4
# 2 21 6 160 110 3.9 2.875 17.02 0 1 4 4
Y el rendimiento parece ser significativamente mejor que la primera respuesta, aunque todavía no es un "impacto cero" en el rendimiento:
microbenchmark::microbenchmark(
a = mtcars %>%
dplyr::mutate(),
b = mtcars %>%
dplyr::mutate(myfun1())
)
# Unit: milliseconds
# expr min lq mean median uq max neval
# a 1.5965 1.7444 1.883837 1.82955 1.91655 3.0574 100
# b 3.4748 3.7335 4.187005 3.92580 4.18140 19.4343 100
(Esta porción se guardó para la prosperidad, aunque tenga en cuenta que getAnywhere
se encontrará dplyr::mutate
incluso si mutate
se define y llama al non-dplyr anterior ).
Sembrado por los enlaces de Rui, sugiero que la búsqueda de funciones específicas podría muy bien perder nuevas funciones y / o funciones válidas pero con nombres diferentes. (No tengo un ejemplo claro). A partir de aquí, considere buscar paquetes particulares en lugar de funciones particulares.
search_calling_pkg <- function(pkgs) {
call_st <- lapply(sys.calls(), `[[`, 1)
res <- any(vapply(call_st, function(ca) any(pkgs %in% tryCatch(getAnywhere(as.character(ca)[1])$where, error=function(e) "")), logical(1)))
if (!res) {
stop("not called from packages")
} else return()
}
myfun <- function() {
search_calling_pkg("package:dplyr")
NULL
}
Tenga en cuenta que esta no es una operación económica. Creo que la mayor parte del tiempo que pasamos en esto se ocupa del árbol de llamadas, tal vez no sea algo que podamos remediar fácilmente.
microbenchmark::microbenchmark(
a = mtcars %>% mutate(),
b = mtcars %>% mutate(myfun())
)
# Unit: milliseconds
# expr min lq mean median uq max neval
# a 1.872101 2.165801 2.531046 2.312051 2.72835 4.861202 100
# b 546.916301 571.909551 603.528225 589.995251 612.20240 798.707300 100
Si cree que se llamará con poca frecuencia y su función toma "un poco de tiempo", entonces quizás el retraso de medio segundo no sea tan notable, pero con este ejemplo de juguete la diferencia es palpable.
Arriba @ r2evans muestra cómo package::function()
se puede resolver la cuestión general de cómo comprobar si una función se llama desde dentro de otra .
Si uno no quiere depender de rlang
las funciones internas, una posible solución es usar rlang::env_name(environment(fun = ...))
, sin embargo, en este caso, solo se puede verificar el espacio de nombres / paquete de la función que llama y no el nombre de la función:
library(dplyr)
library(rlang)
check_pkg <- function(pkg) {
call_st <- sys.calls()
res <- lapply(call_st, function(x) {
.x <- x[[1]]
tryCatch({
rlang::env_name(environment(fun = eval(.x)))
}, error = function(e) {
NA
})
})
if (!any(grepl(pkg, res, perl = TRUE))) {
stop("`myfun()` must only be used inside dplyr verbs")
}
}
myfun1 <- function() {
check_pkg("namespace:dplyr")
NULL
}
custom_fc <- mutate
mutate <- function(df, x) { force(x); NULL; }
mtcars[1:2,] %>% mutate(myfun1())
#> Error in check_pkg("namespace:dplyr"): `myfun()` must only be used inside dplyr verbs
mtcars[1:2,] %>% dplyr::mutate(myfun1())
#> mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
#> 1 21 6 160 110 3.9 2.620 16.46 0 1 4 4
#> 2 21 6 160 110 3.9 2.875 17.02 0 1 4 4
mtcars[1:2,] %>% custom_fc(myfun1())
#> mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
#> 1 21 6 160 110 3.9 2.620 16.46 0 1 4 4
#> 2 21 6 160 110 3.9 2.875 17.02 0 1 4 4
Creado el 2020-07-13 por el paquete reprex (v0.3.0)
Para mi problema específico para verificar si se llama a una función desde adentro, se dplyr
me ocurrió una alternativa eficiente usando una llamada a across()
como prueba si myfun()
se llama desde adentro dplyr
. A diferencia de mask$...
etc. across()
es una dplyr
función exportada .
library(dplyr)
library(rlang)
check_calling_fn <- function() {
tryCatch({
dplyr::across()
}, error = function(e) {
rlang::abort("`myfun()` must only be used inside dplyr verbs")
})
}
myfun <- function() {
check_calling_fn()
NULL
}
microbenchmark::microbenchmark(
a = mtcars %>% dplyr::mutate(myfun()),
b = mtcars %>% dplyr::mutate()
)
#> Unit: milliseconds
#> expr min lq mean median uq max neval
#> a 2.580255 2.800734 3.783082 3.105146 3.754433 21.043388 100
#> b 1.317511 1.393168 1.713831 1.494754 1.763758 5.645019 100
myfun()
#> Error: `myfun()` must only be used inside dplyr verbs
Creado el 2020-07-06 por el paquete reprex (v0.3.0)
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