Necesito estimar una cantidad de modelos lineales en el mismo conjunto de datos y poner todos los resultados de la regresión en una tabla. Para obtener un ejemplo reproducible, aquí hay una simplificación usando mtcars
:
formula_1 = "mpg ~ disp"
formula_2 = "mpg ~ log(disp)"
formula_3 = "mpg ~ disp + hp"
Actualmente, mi enfoque ha sido:
purrr:map()
para estimar todos los lm
modelos.stargazer::
para producir tablas de salida.library(tidyverse)
library(stargazer)
formula_1 = "mpg ~ disp"
formula_2 = "mpg ~ log(disp)"
formula_3 = "mpg ~ disp + hp"
lst <- list(formula_1, formula_2, formula_3)
models<- lst %>% map(~lm(., mtcars))
stargazer(models, type = "text")
Lo que me da el resultado que estoy buscando:
#>
#> =========================================================================================
#> Dependent variable:
#> ---------------------------------------------------------------------
#> mpg
#> (1) (2) (3)
#> -----------------------------------------------------------------------------------------
#> disp -0.041*** -0.030***
#> (0.005) (0.007)
#>
#> log(disp) -9.293***
#> (0.787)
#>
#> hp -0.025*
#> (0.013)
#>
#> Constant 29.600*** 69.205*** 30.736***
#> (1.230) (4.185) (1.332)
#>
#> -----------------------------------------------------------------------------------------
#> Observations 32 32 32
#> R2 0.718 0.823 0.748
#> Adjusted R2 0.709 0.817 0.731
#> Residual Std. Error 3.251 (df = 30) 2.579 (df = 30) 3.127 (df = 29)
#> F Statistic 76.513*** (df = 1; 30) 139.350*** (df = 1; 30) 43.095*** (df = 2; 29)
#> =========================================================================================
#> Note: *p<0.1; **p<0.05; ***p<0.01
¿Cómo puedo poner todas las fórmulas en una lista cuando hay muchas fórmulas? La siguiente línea funciona si solo hay 3 fórmulas, pero parece torpe cuando hay muchos modelos para estimar.
lst <- list(formula_1, formula_2, formula_3)
¿Existe una mejor manera de realizar toda la tarea, usando say broom
u otro método? ¿O es purrr:map()
una solución razonable?
Aquí hay un flujo de trabajo que sugeriría. Podemos usar tibble
s anidados para estructurar nuestros datos y usarlos broom
para obtener estimaciones ordenadas y valores ajustados:
library(tidyverse)
library(broom)
# Created nested tibble
nested_df <- tibble(formula = c("mpg ~ disp", "mpg ~ log(disp)", "mpg ~ disp + hp")) %>%
group_by(ID = formula) %>%
group_modify(~ as_tibble(mtcars)) %>%
nest()
# Get model estimates
nested_df %>%
mutate(estimates = data %>% map2(ID, ~ tidy(lm(.y, data = .x)))) %>%
select(-data) %>%
unnest()
# Get fitted values and residuals
nested_df %>%
mutate(model = ID %>% map2(data, lm),
stats = model %>% map(augment)) %>%
select(-data, -model) %>%
unnest()
Salida:
> nested_df
# A tibble: 3 x 2
ID data
<chr> <list>
1 mpg ~ disp <tibble [32 x 11]>
2 mpg ~ disp + hp <tibble [32 x 11]>
3 mpg ~ log(disp) <tibble [32 x 11]>
# A tibble: 7 x 6
ID term estimate std.error statistic p.value
<chr> <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 mpg ~ disp (Intercept) 29.6 1.23 24.1 3.58e-21
2 mpg ~ disp disp -0.0412 0.00471 -8.75 9.38e-10
3 mpg ~ disp + hp (Intercept) 30.7 1.33 23.1 3.26e-20
4 mpg ~ disp + hp disp -0.0303 0.00740 -4.10 3.06e- 4
5 mpg ~ disp + hp hp -0.0248 0.0134 -1.86 7.37e- 2
6 mpg ~ log(disp) (Intercept) 69.2 4.19 16.5 1.28e-16
7 mpg ~ log(disp) log(disp) -9.29 0.787 -11.8 8.40e-13
# A tibble: 96 x 12
ID mpg disp .fitted .se.fit .resid .hat .sigma .cooksd .std.resid hp log.disp.
<chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 mpg ~ disp 21 160 23.0 0.664 -2.01 0.0418 3.29 0.00865 -0.630 NA NA
2 mpg ~ disp 21 160 23.0 0.664 -2.01 0.0418 3.29 0.00865 -0.630 NA NA
3 mpg ~ disp 22.8 108 25.1 0.815 -2.35 0.0629 3.28 0.0187 -0.746 NA NA
4 mpg ~ disp 21.4 258 19.0 0.589 2.43 0.0328 3.27 0.00983 0.761 NA NA
5 mpg ~ disp 18.7 360 14.8 0.838 3.94 0.0663 3.22 0.0558 1.25 NA NA
6 mpg ~ disp 18.1 225 20.3 0.575 -2.23 0.0313 3.28 0.00782 -0.696 NA NA
7 mpg ~ disp 14.3 360 14.8 0.838 -0.462 0.0663 3.31 0.000770 -0.147 NA NA
8 mpg ~ disp 24.4 147. 23.6 0.698 0.846 0.0461 3.30 0.00172 0.267 NA NA
9 mpg ~ disp 22.8 141. 23.8 0.714 -0.997 0.0482 3.30 0.00250 -0.314 NA NA
10 mpg ~ disp 19.2 168. 22.7 0.647 -3.49 0.0396 3.24 0.0248 -1.10 NA NA
# ... with 86 more rows
Si prefiere una stargazer
tabla, podemos también pull
la model
salida lista de columnas:
library(stargazer)
nested_df %>%
mutate(model = ID %>% map2(data, ~ lm(.x, .y))) %>%
pull(model) %>%
stargazer(type = "text")
Salida:
=========================================================================================
Dependent variable:
---------------------------------------------------------------------
mpg
(1) (2) (3)
-----------------------------------------------------------------------------------------
disp -0.041*** -0.030***
(0.005) (0.007)
hp -0.025*
(0.013)
log(disp) -9.293***
(0.787)
Constant 29.600*** 30.736*** 69.205***
(1.230) (1.332) (4.185)
-----------------------------------------------------------------------------------------
Observations 32 32 32
R2 0.718 0.748 0.823
Adjusted R2 0.709 0.731 0.817
Residual Std. Error 3.251 (df = 30) 3.127 (df = 29) 2.579 (df = 30)
F Statistic 76.513*** (df = 1; 30) 43.095*** (df = 2; 29) 139.350*** (df = 1; 30)
=========================================================================================
Note: *p<0.1; **p<0.05; ***p<0.01
Tenga en cuenta que group_modify
actualmente es experimental, así que utilícelo con precaución, ya que es probable que sus propiedades e intención cambien en el futuro.
También vea mi otra respuesta para un problema relacionado: coloque los resultados de predict () en un bucle for dentro de una lista
Si ya tiene las fórmulas guardadas en su entorno global, entonces puede hacer una lista como esta:
formula_list<-do.call("list",mget(grep("formula",names(.GlobalEnv),value=TRUE)))
que te da:
#> $formula_1 #> [1] "mpg ~ disp" #> #> $formula_2
#> [1] "mpg ~ log(disp)"
#>
#> $formula_3
#> [1] "mpg ~ disp + hp"
Creo que usarlo purrr::map
es un buen enfoque. Pero otros pueden tener mejores ideas.
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